實驗室主要為理化實驗室，也需要做一個小面積的無菌室，大型精密儀器（像GC-MS，ICP等）一般單獨設置一個房間做為儀器室。樣品制備等實驗室應該盡可能方便儀器室及分析室取樣為佳。
主要功能房間如下：
辦公區：
化分室、
離子色譜室、
原子吸收室、
原子熒光室、
氣相色譜室、
氣瓶室、
生物室、
樣品接收室、
固體藥品室、
液體藥品室
比色室、
天平室
制水室、
樣品預處理室、
紅外測油室